多范围测序揭示了TP53驱动的非小细胞肺癌的瘤内异质性
浏览量:3456    更新时间:2016/11/13 17:52:11
 
  来自上海第九人民医院和上海交通大学联合报道的一篇关于TP53驱动肺癌的瘤内异质性研究证实,TP53的获得性突变是出现在肿瘤进展的较晚期,单一检测TP53突变可能无法揭示早期恶性肿瘤的风险。
  非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤内遗传异质性(ITH)是靶向治疗产生耐药性的重要原因,给个体化治疗带来挑战。对患者ITH性的全面了解可以帮助临床识别高危病人从而制定有效的针对性的治疗方案。然而,ITH性往往容易被病人间异质性和大量的偶然突变所掩盖。为了减少这种干扰,研究人员选择了已经携带TP53突变的NSCLC患者来筛选潜在的驱动基因包括循环突变基因。试验对12个对肿瘤组织和周边正常组织进行全基因组和全外显子组测序分析,并检测到了2342个非沉默体细胞突变。其中367个高频突变基因被筛选作为潜在驱动基因,在61个激光捕获显微切割获得的肿瘤局部组织样本中对这367个基因进行深度测序。在实验中中观察到,入组的12个肿瘤样本均存在异质性,表现出分支进化的特点。尽管这12个肿瘤单一组织活检都观察到了TP53突变,但是测序结果显示:在大部分肿瘤中,TP53突变和未突变的细胞都存在。这表明TP53的获得性突变是出现在肿瘤进展的较晚期。因此,单一组织活检TP53突变可能无法充分反映早期恶性肿瘤的风险。
  TP53作为重要的抑癌基因,其突变对肿瘤的发生和发展都有着非常关键的作用;针对肿瘤的高通量测序,也很少会遗漏这个基因;目前肿瘤治疗方法的改进,必将依赖于对TP53突变的深入研究,尤其是对其ITH性质的进一步了解。