通过完整的临床随访对早期肺腺癌进行全外显子测序和免疫分析
浏览量:2682    更新时间:2016/11/13 17:48:20
 
  大多数因肺癌致死的人都是死于肺腺癌(LUAD)。我们对早期阶段肺腺癌进行全外显子测序(WES)和免疫分析的临床随访,以更好地了解这种疾病的发病机制和确定临床相关的分子标记。我们使用Illumina HiSeq 2000平台进行了108对配对的I-III期肺腺癌和正常肺组织的WES,并通过使用免疫组织化学在肺腺癌患者的子集(n = 92)中分析了10种免疫标记物(PD-L1,PD-1,CD3,CD4,CD8,CD45ro,CD57,CD68,FOXP3和Granzyme B)的表达,再使用ANOVA和Fisher精确检验分析突变,免疫标记物和临床病理变量之间的关联,Cox比例风险回归模型用于临床结果的多变量分析。该队列中的肺腺癌平均检测到243个编码突变,我们确定了其中28个具有显着富集突变的基因。SETD2突变的肺腺癌表现出相对较差的无复发生存期(RFS),STK11和ATM中的突变与KRAS突变体肿瘤中较差的RFS相关。 EGFR,KEAP1和PIK3CA突变预示患者对辅助治疗有不良反应。免疫标记分析显示,吸烟者和具有相对高的突变的肺腺癌显示出免疫标记物的水平较高。免疫表型的分析揭示具有STK11突变的肺腺癌显示相对低水平的浸润CD4 + / CD8 + T细胞的水平,说明其发生了免疫应答沉默。肿瘤PD-L1表达在TP53突变体肺腺癌中显著升高,而在PIK3CA突变体肺腺癌明显下调。具有TP53或KEAP1突变的肺腺癌表现出相对增加的CD57和粒酶B水平,表明增强的自然杀伤细胞能力。
  通过研究肺腺癌的基因突变和免疫表型,能够进一步分析病人的临床反应和个性化免疫治疗的作用,更好地辅助临床诊断和治疗